顏寧
 
  顏寧,1996年考入我校生物系,2000年獲生物系學士學位,并獲優良畢業生;2004年于美國普林斯頓大學分子生物學系獲博士學位。2007年受聘清華大學醫學院教授、博士生導師。2009年至今以通訊作者在《自然》、《科學》、《細胞》發表學術論文9篇。并獲多項國際和國家科學獎,包括:2005年獲得Science/AAAS和GE Healthcare 青年科學家獎(北美地區);2011年獲得中國優秀青年科技工作者;2012年獲得國家自然科學基金委杰出青年科學基金、美國HHMI首屆國際青年科學家獎、談家楨生命科學創新獎。
 
  顏寧教授
 
  1996—2000 清華大學生物科學與技術系,學士
 
  2000—2004 美國普林斯頓大學分子生物學系,博士
 
  2005—2007 美國普林斯頓大學分子生物學系,博士后
 
  2007-至今  清華大學教授
 
  顏寧主要科研領域與方向
 
  人類基因組中編碼蛋白的所有基因約有30%編碼膜蛋白(membrane proteins)。膜蛋白在一切生命過程中起著關鍵作用,具有重要的生理功能。FDA批準上市的藥物中,約50%的作用靶點為膜蛋白。因此,對膜蛋白結構與功能的研究具有極高的生物學意義及醫藥應用前景。但是由于研究手段有限,對膜蛋白的生物學功能以及結構研究極為困難。
 
  轉運蛋白(transport proteins)是膜蛋白的一大類,介導生物膜內外的化學物質以及信號交換。脂質雙分子層在細胞或細胞器周圍形成了一道疏水屏障, 將其與周圍環境隔絕起來。盡管有一些小分子可以直接滲透通過膜,但是大部分的親水性化合物,如糖,氨基酸,離子,藥物等等,都需要特異的轉運蛋白的幫助來通過疏水屏障。因此,轉運蛋白在營養物質攝取,代謝產物釋放以及信號轉導等廣泛的細胞活動中起著重要的作用。大量疾病都與膜轉運蛋白功能失常有關,轉運蛋白是諸如抗抑郁劑,抗酸劑等大量藥物的直接靶點。
 
  我們的研究興趣主要集中在次級主動運輸蛋白(secondary active transporters)的工作機理上。交替通路模型(alternating-access model)被用來解釋轉運蛋白的工作機理,在這個模型中,轉運蛋白至少采取兩種構象來進行底物的裝載及卸載:一種向膜外開放,一種向膜內開放。有許多結構和生物物理學證據支持這個模型。但是,仍有兩個最有趣的基本問題沒有解決。第一,主動運輸的能量偶聯機制是什么?第二,在轉運過程中,是什么因素觸發了轉運蛋白的構象變化?我們實驗室使用基于結構的研究手段對次級主動運輸蛋白進行研究,以期解決轉運蛋白工作機理中的基本問題。
顏寧,顏寧教授,顏寧主要科研領域與方向
顏寧,顏寧教授,顏寧主要科研領域與方向
  Publications
 
  1.Sun L, Zeng X, Yan C, Sun X, Gong X, Rao Y, Yan N. Crystal structure of a bacterial homologue of glucose transporters GLUT1–4. Nature, 2012; 490:361–366.
 
  2.Yin P, Deng D, Yan C, Pan X, Xi JJ, Yan N*, Shi Y*.Specific DNA-RNA Hybrid Recognition by TAL Effectors. Cell Rep. 2012; Sep 26. Epub ahead of print (co-corresponding authors)
 
  3.Deng D, Yin P, Yan C, Pan X, Gong X, Qi S, Xie T, Mahfouz M, Zhu JK, Yan N*, Shi Y*. Recognition of methylated DNA by TAL effectors. Cell Res. 2012;22(10):1502-4. (co-corresponding authors)
 
  4.Zhang X, Ren W, DeCaen P, Yan C, Tao X, Tang L, Wang J, Hasegawa K, Kumasaka T, He J, Wang J, Clapham DE, Yan N. Crystal structure of an orthologue of the NaChBac voltage-gated sodium channel. Nature. 2012;486(7401):130-4.
 
  5.Tian Xie, Ruobing Ren, Yuan-yuan Zhang, Yuxuan Pang, Chuangye Yan, Xinqi Gong, Yuan He, Wenqi Li, Di Miao, Qi Hao, Haiteng Deng, Zhixin Wang, Jia-Wei Wu and Nieng Yan. Molecular Mechanism for Inhibition of a Critical Component in the Arabidopsis thaliana Abscisic Acid Signal Transduction Pathways, SnRK2.6, by Protein Phosphatase ABI1. J Biol Chem. 2012; 287:794-802.
 
  6.Dong Deng, Chuangye Yan, Xiaojing Pan, Magdy Mahfouz, Jiawei Wang, Jian-Kang Zhu, Yigong Shi*, and Nieng Yan* Structural basis for the specific recognition of DNA by TAL effectors. Science. 2012; 335(6069):720-3, Epub: 2012 Jan 5. (* indicates corresponding authors)。
 
  7.Hao Q, Yin P, Li W, Wang L, Yan C, Lin Z, Wu JZ, Wang J, Yan SF, Yan N. The molecular basis of ABA-independent inhibition of PP2Cs by a subclass of PYL proteins.Mol Cell. 2011;42(5):662-72.
 
  8.Lu F, Li S, Jiang Y, Jiang J, Fan H, Lu G, Deng D, Dang S, Zhang X, Wang J, Yan N. Structure and mechanism of the uracil transporter UraA. Nature. 2011;472(7342):243-6.
 
  9.Dang S, Sun L, Huang Y, Lu F, Liu Y, Gong H, Wang J, Yan N. Structure of a fucose transporter in an outward-open conformation. Nature. 2010;467(7316):734-8.
 
  10.Yuan X, Yin P, Hao Q, Yan C, Wang J, Yan N. Single amino acid alteration between valine and isoleucine determines the distinct pyrabactin selectivity by PYL1 and PYL2. J Biol Chem. 2010; 285(37):28953-8.
 
  11.Hao Q, Yin P, Yan C, Yuan X, Li W, Zhang Z, Liu L, Wang J, Yan N. Functional mechanism of the abscisic acid agonist pyrabactin. J Biol Chem. 2010;285(37):28946-52.
 
  12.Qi S, Pang Y, Hu Q, Liu Q, Li H, Zhou Y, He T, Liang Q, Liu Y, Yuan X, Luo G, Li H, Wang J, Yan N*,Shi Y*. Crystal structure of the Caenorhabditis elegans apoptosome reveals an octameric assembly of CED-4. Cell. 2010;141(3):446-57. (co-corresponding authors)
 
  13.Wang Y, Huang Y, Wang J, Cheng C, Huang W, Lu P, Xu YN, Wang P, Yan N*, Shi Y*. Structure of the formate transporter FocA reveals a pentameric aquaporin-like channel. Nature. 2009;462(7272):467-72. (co-corresponding authors)
 
  14.Yin P, Fan H, Hao Q, Yuan X, Wu D, Pang Y, Yan C, Li W, Wang J, Yan N. Structural insights into the mechanism of abscisic acid signaling by PYL proteins. Nat Struct Mol Biol. 2009;16(12):1230-6.
 
  Prior to 2007
 
  15.Yan N, Shi Y. Allosteric activation of a bacterial stress sensor. Cell. 2007;131(3):441-3.
 
  16.Wu Z*, Yan N*, Feng L*, Oberstein A, Yan H, Baker RP, Gu L, Jeffrey PD, Urban S, Shi Y. Structural analysis of a rhomboid family intramembrane protease reveals a gating mechanism for substrate entry.Nat Struct Mol Biol. 2006;13(12):1084-91.(co-first authors)
 
  17.Yan N, Huh JR, Schirf V, Demeler B, Hay BA, Shi Y. Structure and activation mechanism of the Drosophila initiator caspase Dronc. J Biol Chem. 2006;281(13):8667-74.
 
  18.Yan N, Xu Y, Shi Y. 2:1 Stoichiometry of the CED-4-CED-9 complex and the tetrameric CED-4: insights into the regulation of CED-3 activation. Cell Cycle. 2006;5(1):31-4.
 
  19.Yan N, Shi Y. Mechanisms of apoptosis through structural biology. Annu Rev Cell Dev Biol. 2005; 21:35-56.
 
  20.Yan N, Chai J, Lee ES, Gu L, Liu Q, He J, Wu JW, Kokel D, Li H, Hao Q, Xue D, Shi Y. Structure of the CED-4-CED-9 complex provides insights into programmed cell death in Caenorhabditis elegans. Nature. 2005; 437(7060):831-7.
 
  21.Yan N, Gu L, Kokel D, Chai J, Li W, Han A, Chen L, Xue D, Shi Y. Structural, biochemical, and functional analyses of CED-9 recognition by the proapoptotic proteins EGL-1 and CED-4. Mol Cell. 2004; 15(6):999-1006.
 
  22.Yan N, Wu JW, Chai J, Li W, Shi Y. Molecular mechanisms of DrICE inhibition by DIAP1 and removal of inhibition by Reaper, Hid and Grim. Nat Struct Mol Biol. 2004;11(5):420-8.
 
  23.Yan N, Shi Y. Histone H1.2 as a trigger for apoptosis. Nat Struct Biol. 2003;10(12):983-5.
 
  24.Chai J*, Yan N*, Huh JR, Wu JW, Li W, Hay BA, Shi Y. Molecular mechanism of Reaper-Grim-Hid-mediated suppression of DIAP1-dependent Dronc ubiquitination. Nat Struct Biol. 2003;10(11):892-8. (co-first authors)